擔(dān)保合同糾紛能申請仲裁。當(dāng)事人可以自行協(xié)議約定管轄機(jī)構(gòu)和仲裁事項(xiàng)，發(fā)生擔(dān)保合同糾紛時(shí)當(dāng)事人不愿和解、調(diào)解或者和解、調(diào)解不成的，可以根據(jù)合同約定向仲裁機(jī)構(gòu)申請仲裁。

《仲裁法》第四條當(dāng)事人采用仲裁方式解決糾紛，應(yīng)當(dāng)雙方自愿，達(dá)成仲裁協(xié)議。沒有仲裁協(xié)議，一方申請仲裁的，仲裁委員會(huì)不予受理。第十條仲裁委員會(huì)可以在直轄市和省、自治區(qū)人民政府所在地的市設(shè)立，也可以根據(jù)需要在其他設(shè)區(qū)的市設(shè)立，不按行政區(qū)劃層層設(shè)立。仲裁委員會(huì)由前款規(guī)定的市的人民政府組織有關(guān)部門和商會(huì)統(tǒng)一組建。設(shè)立仲裁委員會(huì)，應(yīng)當(dāng)經(jīng)省、自治區(qū)、直轄市的司法行政部門登記。