1、原則上，分居三個月起訴離婚子女的監(jiān)護權(quán)由雙方協(xié)商。協(xié)商不成的，由人民法院根據(jù)子女的權(quán)益和雙方的具體情況作出判決。一般來說，除特殊情況外，兩歲以下的子女由母親撫養(yǎng)。

2、根據(jù)《中華人民共和國民法典》第一百零八十四條的規(guī)定，父母與子女之間的關(guān)系不得因父母離婚而消除。離婚后，子女由父母直接撫養(yǎng)，仍然是父母雙方的子女。離婚后，父母仍有撫養(yǎng)、教育和保護子女的權(quán)利和義務(wù)。

3、離婚后，兩歲以下的子女由母親直接撫養(yǎng)。兩歲以上的子女，父母雙方不能就撫養(yǎng)問題達成協(xié)議的，由人民法院根據(jù)雙方的具體情況和最有利于未成年子女的原則作出判決。子女八歲以上的，應(yīng)當尊重其真實意愿。

法律依據(jù)：

《中華人民共和國民法典》第一千零八十四條 【離婚后的父母子女關(guān)系】父母與子女間的關(guān)系，不因父母離婚而消除。離婚后，子女無論由父或者母直接撫養(yǎng)，仍是父母雙方的子女。

離婚后，父母對于子女仍有撫養(yǎng)、教育、保護的權(quán)利和義務(wù)。

離婚后，不滿兩周歲的子女，以由母親直接撫養(yǎng)為原則。已滿兩周歲的子女，父母雙方對撫養(yǎng)問題協(xié)議不成的，由人民法院根據(jù)雙方的具體情況，按照最有利于未成年子女的原則判決。子女已滿八周歲的，應(yīng)當尊重其真實意愿。